为更好地服务国家西南生态安全维护和区域经济社会协调发展等重大需求，云南大学与中国科学院昆明植物研究所合作，依托生态与环境学院，整合校内外生物多样性研究方面的优势力量，于2022年成立“云南大学生物多样性研究院”；2023年，云南大学以生物多样性研究院和国际河流与生态安全研究院为主体，整合校内外相关学科的优势资源，申报并成功获批“西南跨境生态安全教育部重点实验室”。目前，生物多样性研究院与西南跨境生态安全教育部重点实验室成为我校开展生物多样性保护和生态安全研究的主要平台。
该平台依托生物多样性研究院和西南跨境生态安全教育部重点实验室，开展有组织的科研、人才培养和国际合作等，力争建设成为国家生态安全领域的科技创新策源地、科技成果转化基地、拔尖人才培养高地、面向南亚东南亚国际合作基地。
